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【记· 疫】① 基因测序 精准溯源
2022年4月9日 17:34

连日来,我市疫情通告不断,在市疾控中心基因测序实验室,严炳清博士和同事们一天也没有休息,一直忙着为阳性核酸标本进行基因测序,旨在为疫情精准溯源、风险研判与预警、毒株变异研究等方面提供关键技术支撑。

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今年2月15日,我市在外地返通人员核酸检测中,发现1人检测结果呈阳性,这也是2022年南通发现的首个阳性本土病例。疫情一触即发,市疾控中心新冠病毒基因测序实验室第一时间行动起来,对该病例的核酸样本进行了基因测序,“我们的测序结果与省疾控中心进行了比对,结果是完全一致的,这标志着我市新冠病毒基因测序水平已经成熟。”市疾控中心微生物检验科科长熊海平介绍,自我市本轮疫情爆发后,该实验室就持续对新发现的新冠病毒阳性感染者的核酸样本进行基因测序,发现一例,测序一例,及时向上级有关部门提交数据分析报告,为疫情溯源、风险研判做出了积极贡献。
  今年元旦前夕,在省疾控中心的大力支持下,市疾控中心顺利建成全市首个新冠病毒基因测序实验室。这标志着该中心可利用高通量测序技术对新冠病毒进行全基因组测序分析研究。

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如果把流调溯源比侦探在蛛丝马迹中寻找线索,那么病毒基因测序则是为“侦探”提供“实锤”的证据,从病原学的角度更准确地认定病毒的来源。“基因测序技术可在第一时间获取新冠病毒的基因组序列信息,通过序列比对,分析新冠病毒的进化及变异情况,为疫情精准溯源提供技术支持,为控制新冠疫情提供科学依据。”熊海平介绍,基因测序的优势在于能够准确锁定在一地流行的是新冠病毒的哪个‘分身’。他举例说,两个感染者的核酸检测均为阳性,但是他们有可能携带的是不同型别的毒株,只有通过基因测序确定感染病毒类型,才能及时研判疫情、采取有针对性的防控措施。记者了解到,在流调工作中,对于已经确定感染源的病例,可以通过基因测序这一“金标准”进行佐证,找不到感染源的病例则能够通过基因测序的结果进行反推溯源。
  31岁的严炳清是去年7月市疾控中心从哈尔滨医科大学病原生物学专业引进的高端人才,疫情发生以来,他几乎每天都不分昼夜地忙碌在实验室。“核酸检测分析的是新冠病毒的特征片段,而核酸测序分析的是新冠病毒的全基因组,操作步骤更为复杂,耗时更长。”严炳清介绍,从一个样品进入实验室到下机进行数据分析,就要30多个小时。只要阳性标本一送来,他和团队成员就马上进入实验室工作,“每个步骤都是不能间断的,特别是不能让实验过程中的中间产物存放太久,否则会影响最终实验结果的精准性。”截至目前,我市本轮疫情共发现阳性病例近百人,通过反复基因测序,严炳清和同事们的操作也越来越娴熟。
  “每次拿到阳性标本进入实验室的那一刻,就深切地感受到疫情就在身边,就在我的手中,心中的使命感和责任感也油然而生。”严炳清,唯有认真谨慎地操作好每一个实验步骤,才能对得起“疾控卫士”这一称呼,才能真正守护好江海百姓的平安和健康。